Tyto antimikrobiální peptidy byly původně odvozeny z obranných systémů hmyzu, savců, obojživelníků atd. a zahrnují především čtyři kategorie:
1. cekropin byl původně přítomen v imunitní lymfě Cecropiamoth, která se vyskytuje hlavně u jiného hmyzu, a podobné baktericidní peptidy se nacházejí také ve střevech prasat.Typicky jsou charakterizovány silně alkalickou N-koncovou oblastí následovanou dlouhým hydrofobním fragmentem.
2. Antimikrobiální peptidy Xenopus (magainin) pocházejí ze svalů a žaludku žab.Bylo také zjištěno, že struktura xenopus antimikrobiálních peptidů je šroubovitá, zejména v hydrofobním prostředí.Konfigurace xenopus antipeptidů v lipidových vrstvách byla studována NMR na pevné fázi.Na základě chemického posunu acylaminové rezonance byly helixy antipeptidů xenopus paralelní dvouvrstvé povrchy a mohly se sbíhat za vzniku 13mm klece s periodickou helikální strukturou 30mm.
3. defensin Obranné peptidy jsou odvozeny z lidských polykaryotických neutrofilních králičích polymakrofágů s kompletním jaderným lalůčkem a střevními buňkami zvířat.Skupina antimikrobiálních peptidů podobných savčím obranným peptidům byla extrahována z hmyzu, nazývaných „peptidy na ochranu proti hmyzu“.Na rozdíl od savčích obranných peptidů jsou obranné peptidy proti hmyzu aktivní pouze proti grampozitivním bakteriím.I obranné peptidy proti hmyzu obsahují šest zbytků Cys, ale způsob vzájemné disulfidové vazby je odlišný.Způsob vazby intramolekulárního disulfidového můstku antibakteriálních peptidů extrahovaných z Drosophila melanogast byl podobný jako u rostlinných obranných peptidů.Za krystalických podmínek jsou obranné peptidy prezentovány jako dimery.
4.Tachyplesin je odvozen od krabů vrápenců, nazývaných přesličky.Konfigurační studie ukazují, že využívá antiparalelní konfiguraci B-skládání (3-8 pozic, 11-16 pozic), ve kteréβ-úhel je vzájemně spojen (8-11 poloh) a mezi polohami 7 a 12 a mezi polohami 3 a 16 jsou vytvořeny dvě disulfidové vazby.V této struktuře je hydrofobní aminokyselina umístěna na jedné straně roviny a šest kationtových zbytků se objevuje na konci molekuly, takže struktura je také biofilní.
Z toho vyplývá, že téměř všechny antimikrobiální peptidy jsou kationtové povahy, i když se liší délkou a výškou;Na high endu, ať už v podobě alfa-helikální respβ-skládací, bittropická struktura je společným znakem.
Čas odeslání: 20. dubna 2023